履约保证金收取标准应该遵循几个原则：
一是履约保证金的数目要大于合同预付款数目，以规避可能存在的风险；
二是履约保证金的数目要与投标保证金持平或稍高，技术含量高、不能准时履约将会给采购人带来巨大损失的项目，要适当提高履约保证金数额；
三是履约保证金数额的确定要与合同付款条件联系起来，初步设想两者之间应该成反比关系，即分阶段付款条件对供应商有利时，履约保证金应该多收，反之则少收。
、质量保证金，施工单位已将工程全部完工，理应工程款全部结清，但是由于工程还没有经过使用，验收时只能从外表检查，工程的质量标准是否达到设计要求，还需要时间的验证，为此建设单位用应付工程款，按一定的比例暂留，待保修期满，为发生质量问题，全部付给施工单位。
建设工程履约保函应在?工程验收合格之后就应该退还，但是可以到保函到期时，才予以退还。履约保函有期限，有期限到期时，到撤消就可以了，并无法律上的强制性规定！行业惯例是工程完结,或者工程验收合格之后就应该退还,但是附期限的保函在保函到期时予以退还。
一般保函的期限是工期结束30到180天，当然，具体的可以灵活操作。
选择有利的工程履约保函条款
承包人在不得不提供履约保函的情况下，应该争取有利的保函条款。在实践中，有以下要点需要注意：
，保函的有限期应为闭口形式，具体可约定为竣工之日或监理工程师签发解除缺陷责任证书后的一个固定时间。
第二，索赔条款应约定发包人的书面索赔与担保人付款之间有一定的间隔时间，以使承包人有足够的时间与发包人谈判，将争端解决在担保人赔付之前。
第三，在征得发包人认可的基础上，履约保函的数额可随工程进度的完成而递减，担保人在保函该减额时应及时提醒承包人办理减额手续，一旦出现赔付，赔付的总金额不得超过担保额。
第四，其他约定。如可约定在监理工程师颁发工程移交证书后，发包人同意用维修保函来代替履约保函;发包人不得将保函转让给第三方等等。
四、甲方认可履约保函吗？
2016年新出政策，履约保函国家大力推广的工程担保业务，所以甲方都是可以接受履约保函的。
五、履约保函的办理方法
1，乙方直接向银行提出申请，提供企业基础资料和项目的相关资料，如果银行审核通过，乙方存保证金到自己公司开立的保函保证金专户后银行会开具一张同等金额的保函。保函保证金专户的资金处于冻结状态，待保函有效期过后或者保函退回银行后可以解冻。
2，乙方寻找担保公司，担保公司在合作银行是有担保额度，担保和银行审核乙方和项目资料后，银行出具履约保函银行保函，为乙方担保。如果甲方需要索赔，银行先赔付，然后划扣担保公司的额度。这种就叫做免保证金办理履约保函。